공문 제12401/TC/TCT는 농림수산물을 구매할 때 세금계산서 없이 부가가치세를 공제하고 환급하는 방법을 규정하며, 이를 지방세무국들이 일관되게 시행하고 해결하도록 안내함
적용 범위
중앙에 직속한 각 성시도 세무국; 농림수산물을 구매하는 기업
핵심 사항
- 농림수산물을 구매할 때 세금계산서가 없는 기업은 명세표를 작성하고 입력부가가치세를 일정 비율(%)로 공제해야 함(조 1).
- 기업이 국내 판매 또는 수출 시 청구증빙제도를 충실히 준수하고 세율을 정확히 적용하여 상품을 판매하면, 구매명세표에 따른 입력부가가치세 공제를 받을 수 있음(호 1).
- 기업이 위 조건을 충족하지 못할 경우 부정행위로 간주되고 입력부가가치세 또는 환급받은 세액의 공제를 거부당함(호 2).
- 세금 정산 검사 중 기업이 구매량과 공제된 세액 또는 환급액을 허위로 신고한 사실을 확인하면, 이를 위반으로 처리함(호 3).
- 지방세무국은 농림수산물을 구매하는 기업에 대해 2003년 이전의 세금 정산 및 환급 검사 사항도 포함하여 미처리된 환급 신청서를 즉시 처리해야 함(마지막 호).
🌐 이 문서의 사회적 영향
- 농림수산물을 구매하는 기업이 부가가치세 규정을 준수하도록 돕기 위함
- 농림수산물에 대한 부가가치세 공제 및 환급 관리를 강화하고 감독하기 위함
- 국내 판매 또는 수출 시 청구증빙제도를 충실히 준수하지 않은 기업에게 어려움을 초래할 수 있음
❓ 자주 묻는 질문
세금계산서가 없는 농림수산물을 구매하는 기업은 무엇을 해야 하는가?
명세표를 작성하고 일정 비율(%)로 입력부가가치세 공제를 해야 함.
국내 판매 또는 수출 시 청구증빙제도를 충실히 준수하는 기업은 어떤 권리를 갖는가?
구매명세표에 따른 입력부가가치세 공제를 받을 수 있음
위 조건을 준수하지 않는 기업은 어떻게 처리되는가?
부정행위로 간주되고 입력부가가치세 또는 환급받은 세액의 공제를 거부당함.
세금 정산 검사 중 기업이 구매량과 공제된 세액 또는 환급액을 허위로 신고한 사실을 확인하면, 어떻게 처리되는가?
위반으로 처리됨
지방세무국은 미처리된 환급 신청서를 언제까지 처리해야 하는가?
미처리된 환급 신청서와 2003년 이전의 세금 정산 및 환급 검사 사항을 즉시 처리해야 함
전문
공문
재무부 12401 TC/TCT 호 2004년 10월 29일
부가가치세 환급 및 공제에 관한
농림수산물에 대한
각 해당 중앙 직할 시·도 세무국 관계기관에게
최근 재무부는 일부 기업과 지방 정부로부터 부가가치세를 공제하거나 환급하는 과정에서 발생한 어려움 및 문제점에 대한 의견을 접수하였습니다. 이와 관련하여 재무부의 의견은 다음과 같습니다:
- 부가가치세법, 1998년 5월 11일 제28호 정부령, 2000년 12월 29일 제79호 정부령, 1998년 6월 27일 제89호 재무부 고시, 2000년 12월 29일 제122호 재무부 고시에 근거하여 농림수산물 구매 시 화물을 판매하지 않는 생산자 또는 어획업자로부터 구입한 경우, 구매 증빙서류가 없는 경우에는 목록을 작성하고 해당 물품의 부가가치세 공제율을 적용할 수 있습니다.
이러한 규정에 따라 농림수산물 구매 기업의 부가가치세 환급 및 결정 과정에서 일관성 있게 처리하기 위해 각 세무국은 다음과 같이 실행해야 합니다:
1. 국내 판매 또는 수출 시 정확한 세율을 적용하고, 국내 판매 시에는 구매자로부터 받은 결제 증빙서류가 있고, 수출 시에는 관세청의 확인이 있는 경우, 매출액을 정확하게 기록하였다면, 검토 결과 해당 기업이 실제 결제 내역 및 구매증명서를 바탕으로 농림수산물 구매 목록을 작성하고 이를 재고에 반영한 것으로 확인되면, 해당 기업의 구매 목록에서 부가가치세 공제 또는 환급 가능한 금액을 계산합니다.
2. 위 조건을 충족하지 못하는 경우, 구체적인 위반 사항을 파악하여 처리해야 합니다: 판매 물품에 대한 세금 계산서를 작성하지 않았거나 실제 매출액을 정확하게 반영하지 않은 경우에는 매출액을 추정하여 세금을 계산하고, 구매 물품에 대한 증빙서류가 부족하거나 목록과 실적 내역이 일치하지 않는 경우 해당 물품의 부가가치세 공제 또는 환급을 거부하며, 이와 함께 법인세를 추정하여 적용합니다.
3. 세무 당국이 현재 세금 결정 및 환급 과정에서 검토 중인 기업에 대해 확인서나 대조 자료를 요청한 경우, 해당 기업의 구매 및 판매 물품에 대한 확인 내용과 시간을 명확히 해야 합니다. 만약 확인 결과가 부정확한 매출액 또는 세금 공제 내역이 있는 것으로 판단되면 위반 사항을 처리해야 하며, 확인 과정에서 지연된 경우 해당 기간 내로 답변하여 처리해야 합니다. 확인 결과 기업의 잘못이 명백하지 않고 실제 구매 및 소비가 이루어졌다면 기업이 이를 증명할 수 있는 경우에는 매출액과 세금 공제를 제외하지 않습니다.
각 세무국은 위 지침에 따라 농림수산물 구매 목록을 바탕으로 부가가치세 환급 및 결정 과정에서 발생한 미처리 사항을 신속하게 처리해야 합니다. 2003년 이전의 기업에 대한 세금 결정 및 환급은 이미 적용된 규정과 지침에 따라 조정하지 않습니다.
시행 중 어려움이 있는 경우 이를 재무부에 보고하여 추가적으로 검토 및 해결하도록 하겠습니다.
관계도
문서를 클릭하면 열립니다. 빨간 테두리＝효력을 변경하는 관계.
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